En raison des mauvaises conditions de conservation des collections, de la dégradation du bâti et de la volonté de valoriser cette richesse patrimoniale en sommeil, une réhabilitation du site semble nécessaire. Dès lors, la Communauté de Communes de l’Ile d’Oléron va missionner le cabinet d’étude MCCO afin de réaliser une étude de diagnostic du site et un inventaire des collections.
Ces dernières, d’une grande richesse, retracent l’histoire agricole de l’ile (jardin de grand-mère avec plantes aromatiques et médicinales, viticulture, outils et machines agricoles, véhicules hippomobiles pour le transport des productions agraires…) et le quotidien d’un paysan insulaire (objets et mobiliers de la vie quotidienne, textile…).

Cependant, dans la perspective de réhabilitation du site et d’une labellisation « Musée de France » des collections de la Maison Paysanne, il est apparu nécessaire de mettre en œuvre un plan de sauvegarde des collections. Ainsi, au mois de mars 2010, l’ensemble des collections (qui correspondent à un volume de 250 m3) a été transféré vers les réserves muséales intercommunales. Certains objets lourds ou volumineux ont nécessité l’intervention de prestataires extérieurs. Mais aussi, certaines opérations ont été réalisées en interne à partir du mois de février 2010, sous le contrôle d’un restaurateur, pour les objets les plus fragiles comme les textiles.

Enfin, des opérations de conservation préventives sont actuellement menées. En effet, les collections organiques sont traitées par anoxie dynamique afin de les désinsectiser et les collections textiles sont micro-aspirées afin de les soustraire à l’action des poussières, insectes et micro-organismes présents. Ces traitements ont été menés sur le site pour les collections textiles et sont actuellement en cours pour les collections organiques au sein des réserves muséales intercommunales.
Toutes ces actions permettent de préserver et de stocker les collections dans de bonnes conditions jusqu’à leur restauration et leur redéploiement, une fois le site réhabilité.